南通市佛教协会是全市佛教徒联合的爱国团体和教务组织。下设六个县（市）佛教协会。市佛教协会换届以来，在市民族宗教事务部门的直接领导下，高举爱国爱教旗帜，积极协助党和政府贯彻宗教信仰自由政策，维护佛教团体、佛教活动场所和信众的合法权益，各项工作正常开展，促进了我市佛教与社会主义社会相适应。