南通佛教整理委员会前身为中国佛教会南通分部，成立于民国2年（1913 )。负责人由天宁寺僧溪三担任。

民国17年( 1928 )6月，南通佛教会在法轮寺成立。溪三、守禅、振宗当选为监理事。振宗、慎逸、少峰、苇一、镜凡、仁寿、慧如七人为执行委员，苇一后补宣传部长，民国23年(1934)，法轮寺方丈振宗任会长。

民园34年(1945)11月，成立了南通县佛教整理委员会。选举智亮为监理委员会主任委员，少峰( 五福寺住持》，录艺(法轮寺住持）为委员。会址: 西寺。

民园35年( 1946)4月召开全体会员大会，改组成立中国佛教会江苏省南通县支会，选举智亮、少峰、录艺、唯心、月明为常务理事。推选智亮为理事长，松樵、达先、瓒明为监事。

民国36年(1947)秋季，江苏省分会饬令各区成立办事处,平潮、四安、石港、金沙等区曾筹划，但均未成立，即告停顿。

民国37年(1948)8月14日，中国佛教会江苏省南通县支会召开例会。是年，南通佛教整理委员会即停止活动。

附:

民国29年( 1941)，日本侵略军驻通日僧小川大洲在南通成立“江北佛学总会”，小川任会长，狼山法聚庵僧朗慧任副会长。到1945年9月狼山法聚庵挂牌成为“江北佛教总会狼山办事处”住址。此外，还在观音山建立“佛教支会”

1956年2月1日。狼山管理委员会成立。3月8日，狼山管委会呈报建立五山管理委员会，10月9日五山管理委员会成立。育枚为主任，正缘为副主任，其任务是领导僧众除维修寺庙外，还配合政府进行五山规划建设。

1958年8月19日撒销五山管理委员会，建立佛教学习委员会。主任育枚、副主任浴尘，委员有自觉、教元、王沄等。南通市佛道教人士大多集中去法轮寺兴办城东玻璃厂，狼山广教寺仅有20~40名僧人常住，1966年10月，南通市佛教学习委员会停止活动。1980年4月5日，南通市佛教学委会重新恢复活动，同年9月8日，正式建立南通市佛教协会。